二韩研究完字典，又对李自成编辑的读音提出意见，认为和官定韵书差异不小。
李自成将来要定都北京，国语自然以京音为基础。
朱元璋虽然定鼎南京，但是南京话并不是官话。南京官话是中原书音在南方的地域变体，而不等同于南京方言，跟老朱的关系也有限。
当初朱元璋对新编的《洪武正韵》不满意，陆续修订两次还是不满意。于是干脆把别人的书改名《洪武通韵》，准备刊行代替《正韵》。后来相关人员牵涉到胡蓝党案，事情就不了了之了。
可见大明法定的官话或读书音先天不足，等老朱驾崩后就更没人当回事了。
到明英宗朱祁镇时，“《洪武韵》……然今惟奏本内依其笔画而已。至于作诗，无间朝野，仍用《唐韵》。”
再过几十年到明武宗，“至今会试榜文，有除《洪武正韵》一部外，不许夹带片纸只字，盖亟欲正韵之行也。岂知以后革去诗赋，士子已不知正韵为何物。而世之作诗者，亦复因仍旧弊，又不知正韵为何书。不务正音，不遵时制，反从侏离艰涩之韵，吾不知其何也。”
到明末钱谦益，“至于《洪武正韵》……而今惟章奏、试院稍用正字，馆选一取协韵而已。学士大夫束置高阁，不复省视。其稍留心者则曰：‘圣祖固以此书为未尽善，此未定之本也。’噫，可叹哉。”
总之，朱元璋对南京官话的产生几乎毫无影响。
等到小朱迁都北上，又分成了南北官话。
简略区别就是北方官话阴阳上去四声，南方官话阴阳上去入五声。（北京读书音直到清末仍然有入声。）
《西儒耳目资》尽管是在北方最终完成，但反映的语音偏南方官话，类似江淮一片。因为鬼佬从南方登陆，长期生活在南方。而且参考的官定韵书也偏南音。（具体发音可见西南官话，约有七八分相似。）
京话是受到南方官话影响形成的北方官话。
即便鞑子不入关，京音土话和后世发音也没很大差别，可以说沟通无障碍。
万历年京人徐效编写过京话韵表，其与后世区别只在于当时京话尚能分辩尖团，比如精，以及某几个韵母等等。而且他在书里记录的是偏文读的北京口语音，若论老百姓实际口音，大概和后世的差别就更小了。
虽然还有些士人们标榜“中州正音”，但京话的地位越来越高。
明中后期很多在京做过官的人，致仕回乡后全家老小，甚或奴仆都“满口燕京音”，并且以此为荣。
总的来说，明代官话和读书音的标准音只存在于纸面上。两百多年下来，各地都有自发形成的特色官话、读书音。最具代表性的是北京官话、南京官话，中原官话三类。