拿到了朝廷的命令之后，马士英就忙碌了起来，首先，他发布了要求地方士绅结寨自守的命令，同时宣布准备新设立一个直属于总督府的亲兵营。
这直属于总督府的亲兵营自然是为孔璋的那些人马准备的。就在马士英到达凤阳之前几天，孔璋就已经带着一支二十来人的参谋队伍到了凤阳了。郑家在凤阳也有店铺，孔璋就在那里住了下来。等马士英一到任，孔璋就赶紧去拜访他。
几天的交道打下来，马士英对孔璋的印象相当的好。他发现，孔璋对于军事确实是真的懂，这一点也得到了他手下的大将黄得功的认可。
黄得功是京营中调过来守卫皇陵的将领，他出身底层，从一个小兵开始，靠着战功一步步升到总兵的位置上，在如今的明朝将领中，也算是很能打仗的了。而且尤其难得的是，他打仗的时候比较老实，花心思少，尤其是什么“死道友不死贫道”的花心思少。而且还有爱民之心，在原本的历史上，黄得功击退张献忠之后，抓到了被张献忠裹挟的万余难民。要是换了左良玉，刘泽清之类的人，说不定就要借这些难民的人头去领个军功了，然而黄得功却让他们各自回到家乡，又把缴获的武器、辎重全都上缴朝廷。这样老实的将领，在明末，真是比大熊猫都稀缺。后来因为拥立弘光有功，黄得功也位列江北四镇之一。左良玉借口南来太子一案发起内讧，黄得功又被调动过去拦截左良玉并击败了他的军队。再后来，满清南下，弘光皇帝朱由菘逃入芜湖黄得功营中，清兵分兵来袭，黄得功率军在荻港与清兵大战。此时已经投降了满清的明军将领刘良佐在岸上大呼招降，黄得功怒斥他，突然不知道从哪里射来了一箭射，正好射穿了他的喉咙，黄得功知道大势已去，便抽出刀自杀，他的妻子也跟着自杀殉国。这人的忠勇，在明军将领中很是出色，只不过这人弄钱的本事就一般了，手中缺钱，养不起太多的军队，所以至少在这个时候，他的实力还很有限。
黄得功是老老实实打过仗的，对于如何打仗自然是很清楚的。所以他和孔璋一交谈，就发现这个秀才好像是真的懂如何打仗的事情。黄得功当上将军之后，也和那些秀才们打过一些交道，比如说如今他的幕中就有一位秀才在给他当师爷，负责起草各种文书。
一般来说，那些秀才们往往读了一点《孙子兵法》，知道几句什么“知己知彼，百战不殆”之类的东西，就觉得自己精通兵事，堪于古之名将比肩。然而只要打过仗的人一听，就知道那全都是胡说八道。一开始，马士英向他介绍孔秀才，并说他通军务的时候，黄得功只把他当成了又一个大言炎炎的家伙而已。但当他们谈论起军务，说到如何行军的时候，孔秀才说的东西却让黄得功吃了一惊――这秀才是真的懂，而且很懂军务的！
孔璋说到的其实也只是模范军在战区一般的行军规定而已，比如在军队出发前，如何派出侦察部队确定地形，确定行军路线，大军营地；如何给所经过区域确定不同的危险等级并安排不同的警戒水平；在何时派出工程人员逢山开路遇水搭桥；如何在行军队伍后方设置掉队人员的收容机构，在路线上设置兵站，保证补给线的畅通。有些方法，黄得功都不知道，但是细细想想，却也不是不可行。总之，如果不是孔秀才有时候提出的一些方法对士兵要求过高，几乎只能用家丁来做，单听这位孔秀才讲这些东西，黄得功甚至都要产生眼前这人并不是一个秀才，而是一个打老了仗的老行伍的错觉。