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按照齐格鲁德的计划，八坂神奈子和泄矢诹访子带走了绿『色』的圆球，而将黑『色』的圆球放在了一座荒山上。
那个被八坂神奈子和泄矢诹访子带走的绿『色』圆球，很快就在十个月之后，变成了一个有着绿『色』头发的女婴，一个生的现人神，拥有着不可思议地奇迹的力量，比起所谓的神迹还要方便和强大许多。
而那个黑『色』的圆球，则在化为了一个黑发的女婴之后，被附近的一个神社的女巫发现，然后捡了回去，作为继承人抚养了起来。顺便一提，这座荒山名叫白马村山，而这座并不大的神社，名字是博丽。
同样却相反的起源，相似却迥异的经历，让两个女孩有了不同的人生。
绿发的女婴在长大成人之后，便理所当然地结婚，然后生下了一个女儿，接着，这个女儿便日渐长大，从母亲那里继承了奇迹的神力，并且变得更强大。在母亲年迈去世后，这个女儿便接过了母亲手上的重担，成为了诹访大社的风祝。
最后，这个新任的风祝同样结婚，然后生下了女儿，传递给了她更强大的奇迹的神力，完成了自己的使命，失去了长生不老的能力，慢慢和心爱的人一起变老然后死去。而下一代的风祝，也紧接着登场，成为新的现人神。
很快，拥有奇迹的神力的绿发的风祝一脉，便被视为了诹访大社的正统继承人，被外界称呼为泄矢神的后代，红红火火的名声传遍了全日本，而泄矢诹访子，也对那些编排这些的人提出任何的异议。
而黑发的女婴，在抚养自己的巫女因为除妖横死之后，年幼的她一个人支撑起了博丽神社的重担，激发了体内被她命名为博丽之力的强大力量，凭借着对妖怪的强大威慑力，还有对人类的绝对慑服力，安全地成长了起来。
然后，已经成长为了一代御姐的博丽的巫女，在一次除妖活动中，捡回来了一个弃婴。这个女婴被她一个人抚养长大，而随着女婴的不断长大，博丽巫女的力量也去到了顶峰。与此同时，她的养女体内，也出现了博丽之力的影子。
然后博丽巫女的养女，成为了强大的新任的博丽的巫女，从她手上接过了历代巫女使用的名字，博丽灵梦！并且在上代博丽巫女开发的博丽之力的使用方法，符咒之上，进行了开发和创新，使得手段更加的多样化。
依靠着血脉，世界树的奇迹神力，因为寄托着神灵的希望而能够将一切能量转化为畏惧和信仰的力量，一代代地传承了下去，并且不断地变强。依靠着情感，魑魅魍魉之王的博丽之力，拥有对生物的绝对压制并且可以自己生产畏惧和信仰自给自足的力量，也一代代地传承了下去，缓缓积累了起来。
而在这段期间，齐格鲁德则是将自己化进了日本的地脉，将各地的龙脉和重灵地进行了复杂的改造，让这片岛国之地，可以吸取包括日月在内的上的星辰的力量，转化为可以代替畏惧和信仰的灵质，联合着希望神力和博丽神力将这片土地进行着潜移默化的改造。